Lista de bases de datos existentes sobre aceitunas y aceites de oliva

Uno de los objetivos del Proyecto OLEUM es establecer una base de datos de acceso abierto para almacenar no solo la información generada por el consorcio OLEUM, sino también para ser interoperable con las bases de datos ya existentes relacionadas con la caracterización del germoplasma del olivo y aceites de oliva.  

Este informe resume específicamente la información sobre las bases de datos existentes relacionadas con la oliva (Olea europea), principalmente hospedadas en Europa, pero también en otras partes del mundo. La información se recopiló a través de los socios del consorcio OLEUM, así como a través de las publicaciones disponibles y consultas por internet.

Se han identificado un total de 15 bases de datos, de las cuales 10 están basadas en páginas webs y actualmente son accesibles. Sin embargo, una base de datos accesible no significa necesariamente que la información disponible pueda reutilizarse total o parcialmente en otra base de datos, por lo que es esencial contactar a cada administrador como un segundo paso.

Con el fin de identificar una variedad de aceite de oliva virgen desconocida, se han establecido varias bases de datos de referencia que proporcionan marcadores morfológicos moleculares de ADN y/o datos químicos de olivos y aceites en todo el mundo. La identificación de la variedad de oliva y la autentificación del aceite de oliva son especialmente importantes para la protección de marcas certificadas como la Denominación de Origen Protegida (DOP) y la Indicación Geográfica Protegida (PGI).

Aparentemente no existe ninguna base de datos que centralice los datos de pasaporte de todas las accesiones de aceitunas distribuidas en los bancos de germoplasma de aceituna existentes. Sin embargo, teniendo en cuenta la información recopilada, parece que un porcentaje significativo del germoplasma de aceituna se conserva en bancos de germoplasma europeos; son el Banco Mundial de Germoplasma de Oliva de Córdoba y la colección CRAOLI, para la cual también hay disponibles tarjetas elaiográficas. Estas tarjetas incluyen datos morfológicos y agronómicos, así como una variedad de descriptores moleculares y químicos. Una enorme cantidad de trabajo ha sido llevado a cabo en las últimas dos décadas para caracterizar las variedades mediante marcadores moleculares, sin embargo, los resultados se difunden en varias bases de datos o publicaciones científicas.  

Varias bases de datos están almacenando datos de la composición química sobre aceites de oliva a partir de análisis químicos convencionales; p.ej. ácidos grasos, triglicéridos, valores organolépticos de aceites.  Solo una base de datos (es decir, Base de datos Nacional Italiana de aceites de oliva virgen extra DOP/IGP) está manteniendo los datos de las mediciones isotópicas, así como de un enfoque metabolómico.

Al compartir e incluso integrar las bases de datos de olivos, en el sentido de los principios “FAIR” de datos recomendados por el marco del Horizonte 2020, se espera que proporcione referencias adecuadas a los datos, para permitir su reutilización, aumentar su reproducibilidad y promover colaboraciones. Actualmente existen varias plataformas técnicas, portales y herramientas disponibles para lograr dicha gestión de los datos que son analizados en el producto final. También se describen tareas adicionales para colaborar e intercambiar datos con los administradores de las bases de datos identificadas y para explorar las bases de datos que aún no figuran.